①實體顯微鏡放大倍數較低,通常為80~100倍,有的最高放大倍數可達160~300倍,但比生物顯微鏡的放大倍數小得多。因此,實體顯微鏡不能觀察動植物的切片,只能觀察霉菌中的某一類和其他較大一些的標本。
②用實體顯微鏡觀察標本,一般不經過制片手續,標本可直接放在物鏡下觀察,可直接用于觀察細小昆蟲形態、種子構造,以及對珠寶古董的考察。
③在實體顯微鏡下可對標本進行解剖,可隨解剖、隨觀察。
④實體顯微鏡所呈的影像是正的,這一點和生物顯微鏡不同。
⑤實體顯微鏡都是雙目鏡,其機內有兩條成12°夾角的獨立的光路,模擬人的雙眼兩條視線,所觀察的像有立體效果。其他生物顯微鏡可以是單目鏡,也可以是雙目鏡,但其雙目鏡,影像仍不是立體的。